074-31555141

施季森教授团队全球首次破译鹅掌楸基因组2020-10-23 08:19

近日,我校施季森教授领衔的团队在国际顶级学术期刊《Nature Plants》上在线公开发表为题《Liriodendron genome sheds light on angiosperm phylogeny and species-pair differentiation》的论文。

施季森教授团队全球首次破译鹅掌楸基因组

该研究首次说明了了木兰类物种中国鹅掌楸的基因组装配、从全基因组水平解析被子植物的系统进化,确认了以鹅掌楸为代表的木兰类植物在被子植物中的进化地位。该成果对于了解理解动植物物种鹅掌楸的演化和遗传,积极开展功能基因检验、最重要性状的分子调控网络和基于基因组的自由选择选育等方面的研究,具备十分最重要的理论和应用于价值。 该项研究以我校林学院陈金慧教授为第一作者,林学院郝兆东博士和华大基因光宣敏、赵辰曦为并列第一作者。施季森教授为第一通讯作者,陈金慧教授、南京大学杨四海教授、华大基因副总裁刘娜为三大通讯作者。木兰类植物是主要被子植物(Mesangiospermae),即核心被子植物中较早于进化出来的一支,对于解读被子植物的进化具备十分最重要的意义。该研究首次基于仅有基因组研究,从分子水平说明了了鹅掌楸为代表的木兰类植物构成于单、双子叶植物分化之前。这一研究结果为解决问题长年后遗症学术界关于木兰类植物、双子叶植物与单子叶植物之间的进化关系的争议,获取了新的最重要证据。此外,本项研究还对东亚-东部北美洲际间断分布的中国鹅掌楸和北美鹅掌楸的群体进化、种内多样性和种间遗传分化模式等展开了全基因组水平的研究。结果显示,与北美鹅掌楸比起,产于于中国的鹅掌楸具备更高的遗传多样性。通过历史种群进化动态追溯研究找到,中国境内东西南北的高山峻岭挤满的简单地形地貌,有可能为第四纪冰川时期产于于中国的鹅掌楸获取了更加不利的避难所生境,留存了较高的遗传多样性。这一研究成果,对于中国鹅掌楸野生种质资源维护、利用、研发及选育获取了重要依据。本项研究工作获得了国家高技术研究发展计划、江苏省重点研发计划、江苏林业局基金、国家重点基础研究发展计划和中国自然科学基金的资助和反对,并与南京大学、华大基因、美国佐治亚大学、美国杰克逊基因组医学实验室、美国加利福利亚大学、湖北省林业厅林木种苗管理总站、中国科学院植物研究所及德国弗莱堡大学等合作已完成。文章链接:https://www.nature.com/articles/s41477-018-0323-6。